他将目光转向阿济格，声音如同从九幽地狱传来：“英亲王阿济格！你辜负圣恩，损兵折将，罪不可恕！”
阿济格脸色煞白，心知不妙。
“本王念在你为大清征战多年的份上，姑且饶你一命！”多尔衮顿了顿，然后一字一顿地说出了判决：“削去英亲王爵位，降为贝勒！其子劳亲，押解盛京，囚禁反省！”
“摄政王！”阿济格大惊失色，高声呼喊，但他不敢为自己辩解，只能眼睁睁看着自己的爵位被削，儿子被拿下囚禁。“至于你……”多尔衮又转向多铎，语气稍缓，但眼中却闪烁着更深层的算计，“豫亲王，你进攻潼关，虽然损失尚可，但指挥亦有失当之处。不过，你毕竟没有丢掉阵地，功过相抵。”
多铎闻言，心中稍稍松了一口气，但总觉得哪里不对。
“本王命你为扬威大将军，继续负责山西、陕西的防务！”多尔衮继续说道，“不过，镶白旗旗主之位，由你的长子多尼继任！”
多铎心中一沉，这是明晃晃的夺权！旗主之位，乃是一旗之根本，如今交给了儿子，虽然血脉相连，但自己手中掌控的力量无疑被大大削弱。
“至于你麾下将领，”多尔衮的声音又冷了下来，“如拜音图等，调往他处，充实边疆防务！本王会另派两黄旗亲信将领，助你一臂之力！”说是“助阵”，实则是安插眼线，夺取军权。多铎心中苦涩，却不敢有任何异议，只能叩首谢恩。
就在多尔衮处理内部矛盾之时，清廷传来了一道圣旨。
顺治皇帝借着这次清军战败的机会，颁布了一道诏书，表面上褒奖多尔衮为“叔父摄政王”，肯定他为大清的贡献，实则巧妙地收回了部分兵权。诏书中明确指出，“凡八旗战损超三成者，需报兵部复核再战”。兵部尚书自然是顺治的人。这等于限制了多尔衮私自调动军队的能力，尤其是在大规模损失之后。多尔衮虽然仍掌管着山西、陕西的防务指挥权，但调兵遣将却不得不受到牵制。
多尔衮看着手中的诏书，脸上没有表情。他知道，这是小皇帝在利用这次失败，试图从自己手中夺取权力。但他此刻无暇顾及这些。眼下的当务之急，是如何应对那个让他感到无比棘手的秦王朱明夷。
关中，已经变成了一块硬骨头，一块随时可能崩掉他牙齿的硬骨头。
他痛定思痛，迅速调整战略，决定暂时放弃对陕西的大规模进攻，转而采取战略收缩，固守山西，经营内部。
首当其冲的便是安置战败的军队。连番大败，清军在山西的兵力锐减。多尔衮将阿济格、多铎两部溃兵与原本驻防的清军进行整合。他尤其畏惧关中秦军的强悍火力，那“霹雳子”和“神机铳”给清军造成的心理阴影极深，于是他决定将八旗精锐集中于重要的城池内，依靠坚固城墙应对秦军可能出现的反击，避免在野战中重蹈覆辙。
太原作为山西首府，多尔衮留下了八千人马，由阿济格坐镇。名义上是城防主将，但实际上，阿济格已被多尔衮剥夺了实际兵权，改为副将，日常事务和指挥权都落在了多尔衮心腹、镶白旗副都统济尔哈朗手中。这位曾经的英亲王，如今不过是个有名无实的摆设，整日郁郁寡欢，借酒消愁，哪里还有昔日八旗战神的模样。
大同，这座扼守晋北的重镇，由原明朝宣大总兵唐通率领一万两千人镇守。唐通是降将，多尔衮并不完全信任，因此将他的防区严格限制在大同城及周边的五座卫所，以防其与蒙古或者北方的反清势力勾结。唐通深知自己的处境，一方面对清廷卑躬屈膝，另一方面也暗中拉拢旧部，为自己留条后路。私底下，他常对亲信叹息：“这世道，谁拳头大谁就是爷。秦王有能耐，硬生生把鞑子打得屁滚尿流，这才叫真本事！”
晋北的代州、雁门关一带，战略位置极为重要，是山西通往蒙古的咽喉。多尔衮将这里交给另一位降将——原李自成部将马科。马科骁勇，但多尔衮同样对他存有猜忌，只拨给他六千人马。这支部队的主要任务是截断山西与蒙古之间的通道，防范秦王朱明夷与蒙古瓦剌部的潜在联系。马科性格粗豪，不在乎这些猜忌，他更关心如何养活手下的兵。他常常私下里抱怨清廷的粮饷不济，士兵们饿得面黄肌瘦，哪有力气去打仗？
晋中地区，平遥等地，是山西的腹地，也是经济比较发达的区域。多尔衮调任原陕西三边总督孟乔芳前来，率领五千汉军驻扎，镇压晋中此起彼伏的义军反抗，确保粮道和驿站的安全。孟乔芳虽然是汉军，对清廷却忠心耿耿，是多尔衮用来控制地方，尤其是汉族官僚和士绅的重要棋子。他奉命在晋中大肆“剿饷”，对富商士绅敲骨吸髓。每当看到那些曾经趾高气昂的晋商跪地求饶，孟乔芳心里却有一种病态的满足。
晋东南的泽州一带，驻扎着清廷册封的平西王吴三桂。他名义上是镇守此地，牵制河南、湖广的南明势力，但实际上，吴三桂却借着这个机会，悄悄地扩充自己的私兵力量，同时也在暗中与山西本地的反清势力，甚至与被清廷猜忌的姜镶等人保持着若有若无的联系，为日后可能出现的变故做着准备。他一面敷衍清廷，一面暗中积蓄力量，如同冬眠的毒蛇，等待时机。
最后，多尔衮在黄河沿岸布置了一万五千人马，由正白旗的马喇希统领水师和沿河绿营。他们的任务是严密封锁黄河渡口，防止南明军队或者秦军从河南、陕西方向渡河北上。马喇希治军严厉，但面对广阔的黄河防线，兵力依旧捉襟见肘，尤其忌惮秦军的神机营。