木叶五十八年六月，夏日的炎热在傍晚时分稍稍收敛了些锋芒。火影办公室里，三代火影猿飞日斩坐在堆满文件的桌前，神色平静却难掩疲惫。他的目光扫过桌上的公文，思绪却有些飘远，最近村子里看似风平浪静，可他总有种山雨欲来的预感。
突然，一个暗部成员如鬼魅般出现在门口，单膝跪地汇报：“火影大人，根部那边情况异常，众多根部忍者正匆忙往根部聚集，行为十分反常。”三代火影闻言，手中的笔猛地一顿，眼神瞬间锐利起来，“竟有此事？密切关注，有新情况立刻汇报。”
与此同时，根部大厅内，气氛凝重得像暴风雨来临前的死寂。一名根部忍者满脸惊恐，声音颤抖地喊道：“舌祸根绝之印消失了……”这话如同一颗重磅炸弹，瞬间在人群中掀起轩然大波。另一名忍者满脸不信，怒吼道：“不可能！团藏大人带着精锐去了火之寺，怎么可能出事，这印肯定是出了什么差错！”
可事实摆在眼前，越来越多的根部忍者察觉到印的消失，他们从小被团藏洗脑，对其绝对忠诚，如今精神支柱轰然倒塌，众人顿时陷入了巨大的迷茫与恐慌之中。大厅里，有人呆立原地，眼神空洞；有人则焦躁地来回踱步，试图寻找答案，可一切都是徒劳。
在木叶村的街道上，那些平日里总是隐藏在黑暗中的根部忍者，此刻却纷纷现身，他们脚步匆匆，神色慌张地朝着根部的方向奔去。他们一反常态的行为，立刻引起了一些敏锐的上忍的注意。
“你看，那些是根部的人吧？怎么都这么慌张？”一位上忍皱着眉头，疑惑地对身旁的同伴说道。他的眼神中透露出警惕，作为木叶的精英忍者，他深知根部的神秘与危险，如此大规模的异常行动，必定预示着有大事发生。
同伴摇了摇头，脸上同样是凝重的神色：“不清楚，肯定是出大事了。根部向来行事隐秘，这次这么明目张胆地聚集，事情恐怕不简单。”两人对视一眼，都从对方眼中看到了担忧，他们停下手中的事情，紧紧盯着那些根部忍者的动向，心中暗自猜测着即将到来的风暴究竟是什么。
暗部这边，早已全面戒备。暗部队长神色冷峻，迅速做出部署：“一部分人继续跟踪根部忍者，随时汇报情况；另一部分跟我去拦下几个，问清楚到底怎么回事。”说罢，他带着几名暗部成员，如黑色的闪电般穿梭在屋顶，很快便拦住了一名根部忍者。
“发生什么事了？为何如此匆忙聚集？”暗部队长厉声问道。那名根部忍者只是冷冷地瞥了他们一眼，一言不发，继续向前赶路。暗部队长见状，眼神一凛，示意手下抓住他。瞬间，三名暗部成员如鬼魅般现身，将根部忍者牢牢控制住。根部忍者没有反抗，仿佛失了魂一般，任由他们摆布。
暗部队长接着审问，可根部忍者牙关紧闭，一个字也不肯透露。暗部队长深知事情严重，又让手下抓住了两名根部忍者，依旧毫无所获。无奈之下，他只能带着这三名根部忍者迅速前往火影办公室。
火影办公室内，三代火影正焦急地等待消息。暗部队长带着三名根部忍者走进来，单膝跪地汇报：“火影大人，我们抓了三名根部忍者，可无论怎么审问，他们都不肯开口。”说着，手下将根部忍者押到三代火影面前。
三代火影站起身，目光如炬，看向三名根部忍者，严肃问道：“根部究竟发生了何事？团藏现在何处？”三名忍者低着头，沉默不语，气氛压抑得让人喘不过气。许久，其中一名忍者缓缓抬起头，眼中满是迷茫与难以置信，说道：“舌祸根绝之印消失了。”
三代火影听到这话，整个人猛地一震，手中的烟斗差点掉落。他深知这印消失意味着什么——要么团藏解除，要么团藏身亡。
“你们所有人的印都消失了？”三代火影再次确认，声音中带着一丝难以掩饰的震惊。他怎么也没想到，那个多年来在暗处与他并肩又时常意见相悖的团藏，竟可能就这样离开了。
短暂的沉默后，三代火影迅速做出决定：“立刻召集所有暗部成员，随我前往根部。务必维持好秩序，不能让事态恶化。”暗部队长领命后，瞬间消失在原地，去执行命令。
此时，木叶的精英忍者们也都察觉到了异样。卡卡西和迈特·凯站在屋顶，远远望着根部的方向。
凯一如既往地活力满满，兴奋地拍了拍卡卡西的肩膀，说道：“卡卡西，你说根部到底出什么事了？这么大动静，可真让人好奇！”
卡卡西双手插兜，依旧一副懒洋洋的模样，他透过护额下的缝隙看着根部，平静地说：“不清楚，先看着吧。根部这次行动诡异，我们别急着行动。”
实际上，他心里也充满了疑惑，隐隐觉得村子将面临一场巨大的变故。
夕日红和御手洗红豆站在另一处楼顶。红豆一脸焦急，大声说道：“红，你说团藏那家伙搞什么鬼？突然这么大动静，不会又有什么阴谋吧？”
红无奈地摇了摇头，“我哪知道，团藏的心思谁能猜得透。他行事向来神秘，这次也不知道在谋划什么。”
红豆眼珠子一转，突然提议：“要不我去买点酒菜，我们边喝边看这场‘好戏’？说不定还能看出点门道呢。”
红犹豫了一下，最终还是点了点头，“行吧，你快去快回。可别喝太多，万一有情况，我们还得应对呢。”
于是，红豆像一阵风似的跑下楼，朝着酒馆的方向奔去，她的身影在街道上快速穿梭，引得路人纷纷侧目。
日向日足、猪鹿蝶三族的族长以及其他忍族族长也纷纷出现，他们站在不同位置，静静地观察着三代火影和暗部的行动。日向日足神色冷峻，双手抱胸，严肃地注视着事态发展，仿佛在向众人宣告，日向一族已做好应对一切的准备；猪鹿蝶三族族长则聚在一起，小声议论着，脸上满是担忧。
三代火影带着几十名暗部成员迅速来到根部门口。他抬头看着那扇紧闭的大门，深吸一口气，随后推门而入。暗部成员们紧紧跟随其后，他们身着黑色制服，脸上戴着面具，只露出一双双警惕的眼睛，气氛紧张得让人窒息。
根部的忍者们看到三代火影和暗部到来，纷纷露出警惕的神色。但失去团藏指挥的他们，如同群龙无首的散沙，不知所措。他们下意识地握紧手中武器，却没有人敢率先发动攻击，眼神中充满了迷茫与犹豫，不知道该如何应对眼前的局面。
根部的大厅被一种紧张且压抑的气氛所笼罩。三代火影站在大厅中央，他那饱经岁月沧桑的脸上此刻神情严肃，眼神锐利如鹰。他的白色头发在微风中轻轻飘动，火影的斗笠下，目光缓缓扫过每一个根部忍者。暗部们整齐地站在三代身后，他们身着黑色的夜行服，脸上蒙着面罩，只露出一双双锐利的眼睛，周身散发着冷峻的气息。
“团藏在哪里？”三代火影的声音打破了沉默，在大厅中回荡。然而，一众根部忍者只是紧紧盯着三代，没有人回答。
三代火影微微皱眉，眼神中透露出一丝威严，继续说道：“舌祸根绝之印消失，你们应该知道团藏死了。”
这时，一个根部忍者站了出来，声音有些颤抖地说：“早上团藏大人带着二十人去火之寺，抓一个怀疑是九尾人柱力的人。”
三代听到“九尾人柱力”这几个字，眼神猛地一凝，沉声道：“从头说。”
根部忍者隼人咽了口唾沫，开始讲述：“昨天上午，飞鸟时雨来找团藏大人，说在火之寺发现一个叫空的忍僧，怀疑他是人柱力。团藏大人派我去火之寺调查空。我读取火之寺忍僧的记忆发现，空几年前暴走，身上覆盖暗红色的查克拉，像是九尾之夜时的九尾查克拉。最后空身上暴发的查克拉把火之寺的封印铁壁摧毁，给火之寺造成巨大伤害。我汇报情况给团藏大人后，今天早上团藏大人便带人去火之寺抓拿空。”
三代火影听完，脸色愈发凝重，他转头对身边的暗部说：“带两队人去追查团藏和空的下落。”暗部们领命后，迅速转身，几个起落便消失在夜色中。
接着，三代火影又看向根部忍者，语气坚定地说：“从现在开始，根部并入暗部，由我接管。”说完，他又对暗部的几个小队长吩咐道：“带根部人员到暗部登记。”
根部的忍者们听到这话，纷纷露出震惊和犹豫的神色。他们互相看了看，不知道该如何是好。这些忍者长期在团藏的领导下，行事风格隐秘而狠辣，对三代的命令一时难以接受。
暗部的小队长们走上前，目光扫视着根部忍者，其中一个小队长开口道：“跟我们走。”声音冰冷，没有丝毫商量的余地。
三代火影和暗部静静地看着根部忍者，等待他们的反应。在沉默了一会儿后，终于有一个根部忍者缓缓迈出脚步，走到暗部身边。其他根部忍者见状，也开始陆陆续续地跟上。
三代火影和暗部都暗暗松了一口气。三代火影看着这些根部忍者，说道：“留下一个熟悉根部的人，其它的跟暗部去暗部总部。”
根部忍者中几个人互相看了看，最后一个身形消瘦的根部忍者走到三代火影面前。随后暗部就带着根部忍者离开了，三代身边只剩下十几名暗部和一名根部忍者。
三代火影对身边的暗部说：“接管根部的一切。”暗部们立刻行动起来，让留下的根部忍者带着他们开始查看根部的东西。
暗部忍者们在根部的各个房间中穿梭，很快就发现了许多令人震惊的东西。大量的人体实验记录、柱间细胞的研究资料、一勾玉和二勾玉的写轮眼。这些写轮眼被保存在特殊的容器中，暗部猜测应该是在宇智波一族被灭族时挖取的。此外，还有团藏移植柱间细胞和写轮眼的详细记录。
一名暗部忍者拿着这些资料，匆匆来到三代火影面前汇报。三代火影听到汇报后，脸色变得十分难看，他快步来到实验室查看。当看到那些触目惊心的资料时，三代火影不禁喃喃道：“团藏……你居然背着我做了这么多见不得光的事。”
随后，三代火影对身边的暗部成员说道：“立刻将这些东西封存，任何人不得泄露。同时，加强对根部的控制，确保不会再有类似的事情发生。”暗部们迅速行动起来，将研究记录和写轮眼封印进卷轴里。
许久之后，暗部把所有见不得光的东西都封印完毕，将封印卷轴交给三代火影。三代火影接过卷轴，看了一眼，便收了起来。他对暗部说：“你们在这里继续清点根部的东西。”
说完，三代火影转身走出根部。此时，外面已经天黑了。月光下，周围的屋顶上站满了人，木叶村的各族族长、上忍们都聚集在这里。根部和暗部的大规模动作根本瞒不住，消息很快就传遍了整个村子。
三代火影看着站在屋顶上的众人，深呼一口气，声音沉稳地说：“根部从今天开始并入暗部，由我统领。”说完，他便转身，在夜色中缓缓离开了。月光洒在三代火影的身上，他的背影显得有些疲惫。