朱全忠让归顺的同州刺史司马邺，到华州（陕西渭南华州区）给匡国节度使（分管华、同两州）韩建捎话：“你不尽早投降，难道还要麻烦老子过去打你吗！”
当天，朱全忠自固市出兵（陕西渭南市东北固市镇），向南渡过渭水。韩建立即派节度副使李巨川请降，进献白银三万两以示诚意，朱全忠这才转奔西南赤水镇（陕西渭南华州区辖镇）。
十一月初五，凤翔节度使李茂贞在田家硙（陕西西安市鄠邑区西）迎接圣驾，昭宗下马接见。初六，抵达周至。
次日，朱全忠追至零口（现为西安市临潼区零口街道，东邻渭南），听闻圣驾西行，与僚佐商议后引军返归赤水镇。
前宰相张濬求见朱全忠，提议道：“韩建与李茂贞纯属一党，不先攻取他，恐怕将来必成后患！”
朱全忠也知韩建曾上疏劝天子临幸凤翔，遂以此为由，率军进逼华州（陕西渭南华州区）。韩建早没了抵抗的勇气，单骑出城拜会朱全忠。
朱全忠用他劝昭宗西幸一事指责，韩建推脱说：“我大字不识一个，但凡表章、文书等类，均由我的副使李巨川所办。”
朱全忠当即令人把李巨川拉到阵前斩首，冷笑着对面如土色的韩建说：“你是许州人，还是衣锦还乡去吧！”
于是改任韩建为忠武节度使（治陈、许二州），派兵护送他到陈州（河南周口市淮阳区）赴任。
此时的长安，大明宫里无天子，中书省内无宰相！
崔胤令太子太师卢渥等二百余人，联名奏请朱全忠向西迎接圣驾，又派官员王溥到赤水镇与朱全忠商议。
朱全忠回信说：“前行有威胁君王的诽谤，后退又背负亏欠国恩的罪名。然而，形势逼人，臣不敢不往！”
十一月十四日，昭宗随李茂贞到达凤翔！
当天，朱全忠进入长安，宰相率百官在长乐坡（陕西西安市东北）迎接。第二天，朱全忠离开长安直趋凤翔，临行前重赏了立场坚定的孙德昭。
十一月十五日，朱全忠所部大将康怀贞在武功击败凤翔将领符道昭。
二十日，朱全忠兵临凤翔城下，驻军军城东。
李茂贞登城喊话：“天子来我这里避难，并非是我无礼，您是受了小人所骗，这才误会我了！”
朱全忠应声道：“韩全诲竟敢劫持天子，我今天特来问罪，并迎陛下还宫。如你确实不曾参与，何不向天子转述我的心意。”
昭宗迫于韩全诲所逼，多次诏令朱全忠返回大梁。
因昭宗就在凤翔，朱全忠担心逼得太紧会危及他的安全，转而挥师攻打凤翔周边重镇，以期孤立凤翔，逼迫李茂贞交出昭宗。
十一月二十三日，宣武军北攻邠州（陕西咸阳彬州）。
二十九日，邠宁节度使、李茂贞养子李继徽降，改回原名杨崇本。朱全忠将他妻子送到河中为质，仍令他镇守邠州。
十二月二十日，朱全忠侄子朱友宁攻破周至，屠城！朱全忠令崔胤率百官及长安居民搬迁到华州。
韩全诲见朱全忠不走，忙以勤王名义向河东李克用、西川（治所成都）王建求援。又派出二十余名宦官，企图多路出陕，动员江、淮一带藩镇出兵威胁朱全忠。
没成想这些人行至金州（陕西安康），被戎昭节度使（治所在金州）冯行袭全部捕杀，还把从他们身上搜到的敕令交于朱全忠。
李克用派大将李嗣昭、周德威进犯朱全忠所属河中（山西西南，治永济）、昭义（山西东南，治长治），用以牵制朱全忠。
王建则以迎驾为名，出兵抢占李茂贞所属山南（川陕交界，治所在陕西汉中）各州。
天复二年（902年）正月，河东大将李嗣昭、周德威攻陷慈州、隰州，进逼晋（晋州，山西临汾）、绛（山西运城新绛县）。
后方有难，加之李茂贞固守不战，朱全忠只得暂时撤军，返归河中。李茂贞、韩全诲这才缓了口气。
三月初四，昭宗与宰相、学士、中尉、枢密使等一众高官饮酒取乐。酒酣耳热之际，李茂贞、韩全诲心中有事，托故离席。
昭宗醉眼迷离的对着宰相韦贻范说：“朕为什么要住在这个烂地方？”
韦贻范答：“臣在外地，确实不知。”
昭宗执拗的反复质问，韦贻范只是不停劝酒。
昭宗又问：“卿怎敢在朕面前谎称不知，卿虽以邪路攫取宰相之位，如果犯了错，朕同样撤了你。”说完，怒视韦贻范，低头喃喃道：“应痛打这厮二十大板！”
又抬头望向韩偓：“这样的人，才配得上宰相！”
韦贻范端起一大碗酒递给昭宗，昭宗没接，他竟把碗送到昭宗嘴边，强行灌酒。
韦贻范由李茂贞所荐，昭宗对他一直不满。而韩偓在昭宗到达凤翔后，也从长安赶来陪侍。
三月十二日，宣武军大将氏叔琮、朱友宁大败李嗣昭、周德威，收复慈、隰二州，生擒李克用之子李廷鸾，乘胜进击河东。
三月十六日，朱全忠指派朱友宁回军再攻李茂贞，屯驻于兴平、武功之间。
四月二十一日，崔胤从华州（陕西渭南华州区）到河中（山西永济）拜见朱全忠，哭着恳请朱全忠尽快发兵，不要让李茂贞再把天子劫持到蜀地。
朱全忠请他喝酒，他浑然不顾宰相身份，亲自手拿拍板，打着节奏唱着曲儿，替朱全忠佐酒助兴。
五月十四日，朱全忠亲率五万精兵自河中出发，进至东渭桥（长安附近）。因久雨不停，在此逗留了十余天。
六月初三，朱全忠抵达虢县（陕西宝鸡市陈仓区虢镇）。
初十，李茂贞尽出主力，在虢县北与朱全忠会战，大败，死伤万余人。
十二日，宣武军将领孙勍出散关（即大散关，位于宝鸡市南郊秦岭北麓），攻陷凤州，切断了李茂贞西退入川之路。
十三日，朱全忠再度进逼凤翔。他身着朝服，面向城池流泪道：“臣只为迎接圣驾回宫，并非要与岐王争胜。”随即沿城搭建五座营寨，将凤翔重重围困起来。
七月，李茂贞的堂弟、保大军节度使李茂勋（治坊州，今陕西延安黄陵县附近），率军屯驻三原（陕西咸阳市辖县），企图支援李茂贞，被宣武军大将康怀贞、孙勍所败。
七月二十八日，西川大将王宗涤、王宗播以借道勤王为名，一举攻克兴元（陕西汉中），生俘李茂贞的义子、山南西道节度使李继密。
九月初二，关中秋雨连绵，气温骤降。
朱全忠因所部士卒多人患病，召集众将商议撤军。将领高季昌、刘知俊率先反对，高季昌说：“天下英雄旁观我们这次勤王护驾已有一年，如今李茂贞已陷入绝境，为什么要在此时撤军，致使前功尽弃！”
朱全忠略感无奈的说：“不是我不愿打，奈何他坚守不出，我们耗不起啊！”高季昌承诺由他想办法诱其出兵！
会后，高季昌花重金招募能进城做间谍的人。骑兵马景主动请缨，对朱全忠说：“此去必死，请大王能收养我的家人。”朱全忠做出一副不忍的样子制止，马景坚决要去。
当时朱友伦奉命自大梁出兵增援，第二天上午即可抵达凤翔境内，按计划应派一队骑兵前出迎接。马景请求给他匹好马，让他掺杂在这队骑兵中伺机而动，朱全忠答应了他。
九月初三，晨，宣武军大营偃旗息鼓，寂无人声。突然，一队骑兵从营中驰出，向东飞奔。马景跃众而出，掉转马头直奔凤翔。自称逃亡，有重大军情需当面向李茂贞禀报。
进入城内，马景对李茂贞说：“朱全忠全军已退，营中仅剩万余老弱残兵把守，今晚也要撤走，请火速进击。”
李茂贞信以为真，当即主力尽出攻向宣武军大营。
当他们逼近营寨时，寂静的营中突然战鼓轰鸣，潜伏已久的宣武军高声呐喊着冲了出来。凤翔军见势不妙，想要退入城内。早有数百骑兵拦截于城下，凤翔军进退不得自相践踏，几乎全军覆没。
李茂贞自此意气消沉，开始与朱全忠讲和，再也不敢矫诏催促朱全忠撤军。立下大功的高季昌，事后则被朱全忠破格提拔为宋州团练使。
高季昌原为朱友恭奴仆，像他这样出身微贱的人在宣武军中还有许多。比如多次击败河东军的大将氏叔琮，之前不过是庞师古麾下一名伍长。
朱全忠虽然狡猾奸诈，在用人上却极其高明，能够不拘一格量才使用，这是他在群雄角逐中脱颖而出的关键所在。
十月初八，朱全忠派幕僚司马邺入城觐见昭宗。
十月十二日，又遣使入城向昭宗进献熊白（一种脂肪油，可强筋壮体）。此后，食物、布匹等物资也开始源源不断进奉城内。东西送来，昭宗每次都客气的让李茂贞先看，李茂贞不敢启封。
十五日，双方经协商约定，不再限制、抢掠凤翔军民出城樵采。
二十一日，李茂贞突然发兵袭击驻扎于城西的宣武军，被击败撤回。
朱全忠令投降的凤翔士卒，穿上鲜艳的红袍在城下招唤城中人归降，凤翔士卒趁夜攀绳而下、找借口砍柴不归的越来越多。
李茂贞再想派兵出城作战，已基本无人肯听。即便勉强去了，也往往一哄而散。李茂贞怀疑昭宗与朱全忠结下了什么密约，便在昭宗居所增派兵力看护。
十一月初一，李茂贞的堂弟、保大军节度使李茂勋，再次率领万余人前来支援，将营寨搭建在凤翔城北一处高坡上，与城中互举烽火为应。
朱全忠知道这是李茂贞的最后希望，只有把李茂勋消灭，才能彻底击垮李茂贞继续抵抗的意志。
十一月初十，宣武军大将孙勍、李晖趁虚向北袭击坊州（陕西延安黄陵县西北）；十二日，天降大雪，宣武军深夜冒雪而行，黎明时分到达鄜州（陕西延安富县），随即发起进攻。城中尚有八千守军，战至午时，鄜州守军溃败，刺史李继璙被擒。
孔勍安抚李茂勋及其他保大军将领家室，派兵维持城内秩序，令李晖暂时代管城中事务，一切安稳如常。李茂勋听闻老窝被夺，立即撤军离去。
此时的凤翔经过长时期的围困早已缺衣乏食，加之寒冬大雪，冻饿而死的百姓横卧街头，转眼便成为他人口中之食，连昭宗都只能靠着出售御衣换钱度日。
十二月，李茂勋遣使向朱全忠请降，恢复本名周彝。
至此，李茂贞所属山南东道各州尽被王建所占，而关中各州则全归朱全忠所有，只剩凤翔一座孤城仍在坚守。
无计可施的李茂贞，准备拿宦官当“替罪羊”赎罪。让人捎信给朱全忠：“祸乱的起因，全在韩全诲。我迎接圣驾，也只是为了让皇上不被其他贼寇所犯。您既要匡复社稷，那就请接走皇上，我愿以残兵败甲以尽绵薄之力。”
朱全忠也不愿把李茂贞逼上绝路，回信说：“我率军到此，就是为了迎回圣驾。您能与我同心合力，这正是我之所愿！”
天复三年（903年）正月初六，李茂贞单独面见昭宗，奏请诛杀韩全诲等人与朱全忠讲和，迎送昭宗返回长安。
昭宗大喜！这一年来他过得提心吊胆，这下终于看到了曙光！
只是此时的他还不清楚，未来的日子会更痛苦！
李茂贞当即安排士卒将韩全诲等宦官全部逮捕诛杀，当晚又杀掉曾欺侮昭宗的李继筠、周承诲、董彦弼等十六人。
正月初七，昭宗派韩偓与赵国夫人到朱全忠军营晓谕；又派使者携韩全诲等人首级递交朱全忠。
正月十二日，凤翔城门打开，双方停战！
宦官们已被李茂贞杀了七十二人，朱全忠仍不解气，密令搜捕藏匿民间、没有随行的宦官，又杀掉九十余人。
正月二十二日，昭宗离开凤翔进入朱全忠军营。
朱全忠一见昭宗，立刻跪拜叩首泪落如雨。昭宗让韩偓将他扶起，哽咽着说：“宗庙社稷，全靠有卿护佑。朕与宗族，托卿重生！”言罢，亲手解下玉带赐给朱全忠。
君臣二人稍作休息便即启程，朱全忠单骑在前引导了十余里，才派侄子朱友伦率军护卫圣驾前行，他留下殿后。
正月二十七日，昭宗再返长安！
二十八日，朱全忠、崔胤联名上奏：“国家承平之时，宦官不掌兵政。天宝以来，宦官逐渐兴盛。德宗贞元末年，羽林卫改为神策左、右军，开始由宦官掌兵。从此他们参知机密，侵夺百司权力。势力大的煽动藩镇、颠覆国家，势力小的卖官鬻爵、祸乱朝政。王室衰乱，全由于此。不彻底铲除，恐怕无法止乱。请将由宦官担任的各司、使职位全部撤除，所管事务归口交由各省司，驻扎在各地藩镇的监军也请一并召回。”
昭宗痛快允准！当天，军队戒严！
数百宦官被赶到内侍省全部诛杀殆尽，嚎哭声响彻内外。在外办事未归的也均被所在地收捕诛杀，只留下三十余名还没成年的小黄门担任仆役。传旨下令等事务，则统交宫女负责。
神策左、右军所属八镇军队全部隶属天子六军，不再单独设置。
至此，为害大唐一百多年的宦官彻底终结！
崔胤兼管六军、十二卫，由此步入人生巅峰！
（注：六军指天子统领的军队；十二卫指左、右卫，左、右骁卫，左、右武卫，左、右威卫，左、右领军卫和左、右金吾卫。是唐初府兵制名称，晚唐已沦为虚名）。